病原体検出マニュアル
病原体検出マニュアルは、感染症法に基づいて感染症の報告がなされる際の検査の標準化のために、国立感染症研究所と全国地方衛生研究所の共同作業で作成されたものであり、感染症対策に係る行政対応における大きな根拠となっております。本マニュアルを使用し、常に評価し、科学の進歩にあったものに改善していくことが常に求められています。
更新情報
- 2025年4月1日 2類感染症 の鳥インフルエンザ（H7N9）のページへのリンクを追加しました
- 2025年3月26日 4類感染症 の「レジオネラ症」を更新しました
- 2025年2月25日 5類感染症 の「後天性免疫不全症候群」を更新しました
- 2025年2月18日 3類感染症 の「コレラ」を更新しました
- 2025年2月18日 1類感染症 の「エボラ出血熱」を削除しました
- 2025年2月18日 1類感染症 の「マールブルグ病」を削除しました
- 2025年2月14日 5類感染症 の「麻しん」・「風しん」の「麻しん・風しん同時検査法」マニュアルを更新しました
- 2025年2月3日 5類感染症 の「咽頭結膜熱」・「流行性角結膜炎」を更新しました
- 2025年1月20日 4類感染症 の「野兎病」を更新しました
- 2024年12月12日 4類感染症 の「鼻疽」を更新しました
- 2024年12月12日 4類感染症 の「類鼻疽」を更新しました
- 2024年11月15日 4類感染症 の「炭疽」を更新しました
- 2024年8月27日 3類感染症 の「腸管出血性大腸菌感染症」を更新しました
- 2024年5月20日 5類感染症 の「感染性胃腸炎 –ロタウイルス–」を更新しました
- 2024年5月2日 4類感染症 の「重症熱性血小板減少症候群（病原体がフレボウイルス属SFTSウイルスであるものに限る。）」を更新しました
マニュアル一覧（PDFファイル）
1類感染症
- エボラ出血熱
- クリミア・コンゴ出血熱
- 痘そう
- 南米出血熱
- ペスト（PDF：620KB） 2012年5月版
- マールブルグ病
- ラッサ熱
2類感染症
- 急性灰白髄炎（ポリオ）（PDF：731KB） 2012年10月版
- 結核
- （関連疾患）ハンセン病（PDF：255KB） 2011年8月版
- ジフテリア（PDF：284KB） 2020年11月版
- 重症急性呼吸器症候群（病原体がコロナウイルス属SARSコロナウイルスであるものに限る）（PDF：253KB） 2004年10月版
- 中東呼吸器症候群（病原体がベータコロナウイルス属MERSコロナウイルスであるものに限る。）
- 鳥インフルエンザ（H5N1）（PDF：1.1MB） 2012年3月版
- 鳥インフルエンザ（H7N9） 2013年6月更新
3類感染症
- コレラ（PDF：601KB） 2025年2月版
- 細菌性赤痢（PDF：574KB） 2012年6月版
- 腸管出血性大腸菌感染症（PDF：2.3MB） 2024年8月版
- 腸チフス（PDF：3.2MB） 2021年9月版
- パラチフス（PDF：3.2MB） 2021年9月版
4類感染症
- E型肝炎（PDF：881KB） 2018年12月版
- ウエストナイル熱
- A型肝炎（PDF：657KB） 2018年12月版
- エキノコックス症（PDF：378KB） 2012年6月版
- エムポックス（PDF：1.7MB） 2023年6月版 （サル痘からの疾患名変更）
- 黄熱
- オウム病
- オムスク出血熱
- 回帰熱（PDF：197KB） 2012年6月版
- キャサヌル森林病
- Q熱
- 狂犬病（PDF：640KB） 2022年2月版
- コクシジオイデス症（PDF：2.7MB） 2023年1月版
- ジカウイルス感染症（PDF：239KB） 2016年3月版
- 重症熱性血小板減少症候群（病原体がフレボウイルス属SFTSウイルスであるものに限る。）（PDF：421KB） 2024年5月版
- 腎症候性出血熱
- 西部ウマ脳炎
- ダニ媒介脳炎
- 炭疽（PDF：1MB） 2024年11月版
- チクングニア熱（PDF：329KB） 2013年3月版
- つつが虫病（PDF：461KB） 2019年6月版
- デング熱（PDF：637KB） 2014年9月版
- 東部ウマ脳炎
- 鳥インフルエンザ（鳥インフルエンザ（H5N1及びH7N9）を除く）
- ニパウイルス感染症（PDF：360KB） 2016年2月版
- 日本紅斑熱（PDF：461KB） 2019年6月版
- 日本脳炎（PDF：285KB） 2013年8月版
- ハンタウイルス肺症候群（PDF：229KB） 2012年9月版
- Bウイルス病（PDF：209KB） 2020年1月版
- 鼻疽（PDF：438KB） 2024年12月版
- ブルセラ症（PDF：1.2MB） 2021年12月版
- ベネズエラウマ脳炎
- ヘンドラウイルス感染症（PDF：360KB） 2016年2月版
- 発しんチフス
- ボツリヌス症（PDF：5.7MB） 2012年12月版
- マラリア（PDF：1.2MB） 2012年7月版
- 野兎病（PDF：4.9MB） 2025年1月版
- ライム病（PDF：245KB） 2012年6月版
- リッサウイルス感染症
- リフトバレー熱
- 類鼻疽（PDF：807KB） 2024年12月版
- レジオネラ症（PDF：1.7MB） 2025年3月版
- レプトスピラ症（PDF：394KB） 2011年12月版
- ロッキー山紅斑熱（PDF：461KB） 2019年6月版
5類感染症 全数把握
- アメーバ赤痢（PDF：639KB） 2012年7月版
- ウイルス性肝炎（E型肝炎及びA型肝炎を除く）（PDF：405KB） 2020年9月版
- カルバペネム耐性腸内細菌目細菌感染症（PDF：2.9MB） 2024年3月版
- 急性弛緩性麻痺（急性灰白髄炎を除く。）
- 急性脳炎（ウエストナイル脳炎、西部ウマ脳炎、ダニ媒介脳炎、東部ウマ脳炎、日本脳炎、ベネズエラウマ脳炎及びリフトバレー熱を除く）
- クリプトスポリジウム症（PDF：1.7MB） 2017年9月版
- クロイツフェルト・ヤコブ病
- 劇症型溶血性レンサ球菌感染症（PDF：480KB） 2024年1月版
- 後天性免疫不全症候群（PDF：5.1MB） 2025年2月版
- ジアルジア症（PDF：1.7MB） 2017年9月版
- 侵襲性インフルエンザ菌感染症（PDF：1.6MB） 2021年12月版
- 侵襲性髄膜炎菌感染症（PDF：3.4MB） 2020年12月版
- 侵襲性肺炎球菌感染症（PDF：5.8MB） 2021年4月版
- 水痘（入院例に限る。） （PDF：345KB） 2011年10月版
- 先天性風しん症候群（PDF：263KB） 2022年10月版
- 梅毒
- 播種性クリプトコックス症（PDF：514KB） 2023年1月版
- 破傷風（PDF：75.4KB） 2020年12月版
- バンコマイシン耐性黄色ブドウ球菌感染症（PDF：5.3MB） 2024年3月版
- バンコマイシン耐性腸球菌感染症（PDF：2.9MB） 2024年3月版
- 百日咳 （PDF：1.9MB） 2024年3月版
- 風しん（PDF：1.7MB） 2022年10月版
- 付属資料「風しん・系統樹作成用の参照株FASTAフォーマット」（ZIP：3KB） 2020年2月版
- 「麻しん・風しん同時検査法」マニュアル（PDF：1,083KB） 2025年2月版
- 麻しん（PDF：1.2MB） 2022年10月版
- 付属資料「麻しん・系統樹作成用の参照株FASTAフォーマット」（ZIP：2KB） 2020年2月版
- 「麻しん・風しん同時検査法」マニュアル（PDF：1,083KB） 2025年2月版
- 薬剤耐性アシネトバクター感染症（PDF：2.9MB） 2024年3月版
5類感染症 定点把握
- RSウイルス感染症（PDF：414KB） 2023年8月版
- 咽頭結膜熱（PDF：1,110KB） 2025年2月版
- A 群溶血性レンサ球菌咽頭炎（PDF：480KB） 2024年1月版
- 感染性胃腸炎
- ロタウイルス（PDF：839KB） 2024年5月版
- ノロウイルス（PDF：1.3MB） 2019年6月版
- サポウイルス（PDF：387KB） 2021年7月版
- アデノウイルス下痢症（PDF：616KB） 2022年5月版
- 水痘 （PDF：345KB） 2011年10月版
- 手足口病 （PDF：1.1MB） 2023年7月版
- 伝染性紅斑
- 突発性発しん （PDF：381KB） 2015年8月版
- ヘルパンギーナ （PDF：1MB） 2018年2月版
- 流行性耳下腺炎（PDF：4.9MB） 2015年1月版
- インフルエンザ（鳥インフルエンザ及び新型インフルエンザ等感染症を除く）（PDF：2.9MB） 2023年8月版
- 新型コロナウイルス感染症（（病原体がベータコロナウイルス属のコロナウイルス（令和二年一月に中華人民共和国から世界保健機関に対して、人に伝染する能力を有することが新たに報告されたものに限る。）であるものに限る。）
- 新型コロナウイルス感染症 2020年3月版
- 新型コロナウイルスゲノム解析 2022年2月版
- 急性出血性結膜炎
- 流行性角結膜炎（PDF：1,110KB） 2025年2月版
- 性器クラミジア感染症
- 性器ヘルペスウイルス感染症（PDF：986KB） 2012年2月版
- 尖圭コンジローマ（およびHPV感染症）（PDF：4.3MB） 2012年9月版
- 淋菌感染症（PDF：302KB） 2013年8月版
- クラミジア肺炎（オウム病を除く）
- 細菌性髄膜炎（髄膜炎菌、肺炎球菌、インフルエンザ菌を原因として同定された場合を除く。）（PDF：14.4MB） 2011年9月版
- マイコプラズマ肺炎（PDF：4.4MB） 2011年9月版
- 無菌性髄膜炎
- エンテロウイルス（PDF：795KB） 2024年3月版
- パレコウイルス（PDF：1MB） 2024年3月版
- ペニシリン耐性肺炎球菌感染症（PDF：2.9MB） 2024年3月版
- メチシリン耐性黄色ブドウ球菌感染症（PDF：2.5MB） 2024年3月版
- 薬剤耐性緑膿菌感染症（PDF：2.9MB） 2024年3月版
その他
- 進行性多巣性白質脳症（PDF：298KB） 2012年8月版
2023年度以前の更新履歴
- 2024年3月28日 5類感染症 の「百日咳」を更新しました
- 2024年3月21日 5類感染症 の「薬剤耐性菌感染症」（ペニシリン耐性肺炎球菌感染症、バンコマイシン耐性腸球菌感染症、薬剤耐性緑膿菌感染症、薬剤耐性アシネトバクター感染症、カルバペネム耐性腸内細菌目細菌感染症）を更新しました
- 2024年3月18日 5類感染症 の「メチシリン耐性黄色ブドウ球菌感染症」を更新しました
- 2024年3月18日 5類感染症 の「バンコマイシン耐性黄色ブドウ球菌感染症」を追加しました
- 2024年3月15日 5類感染症 の無菌性髄膜炎：「エンテロウイルス」を更新しました
- 2024年3月15日 5類感染症 の無菌性髄膜炎：「パレコウイルス」を追加しました
- 2024年1月12日 5類感染症 の「劇症型溶血性レンサ球菌感染症」を更新しました
- 2024年1月12日 5類感染症 の「A 群溶血性レンサ球菌咽頭炎」を更新しました
- 2023年8月29日 5類感染症 の「インフルエンザ（鳥インフルエンザ及び新型インフルエンザ等感染症を除く）」を更新しました
- 2023年8月7日 5類感染症 の「RSウイルス感染症」を更新しました
- 2023年7月4日 5類感染症 の「手足口病」を更新しました
- 2023年6月1日 4類感染症 の「エムポックス」を更新しました
- 2023年5月27日 4類感染症 の「エムポックス」を更新しました
- 2023年5月27日 4類感染症 の「サル痘」の名称を「エムポックス」に変更しました
- 2023年5月27日 5類感染症 の「カルバペネム耐性腸内細菌科細菌感染症」の名称を「カルバペネム耐性腸内細菌目細菌感染症」に変更しました
- 2023年5月9日 新型コロナウイルス感染症 を 5類感染症 に移動しました
- 2023年1月27日 4類感染症 の「コクシジオイデス症」を更新しました
- 2023年1月27日 5類感染症 の「播種性クリプトコックス症」を更新しました
- 2023年1月6日 5類感染症 の「咽頭結膜熱」・「流行性角結膜炎」を更新しました
- 2023年1月4日 5類感染症 の「手足口病」を更新しました
- 2022年11月22日 3類感染症 の「コレラ」を更新しました
- 2022年11月16日 3類感染症 の「コレラ」を更新しました
- 2022年10月28日 3類感染症 の「コレラ」を更新しました
- 2022年10月6日 3類感染症 の「腸管出血性大腸菌感染症」を更新しました
- 2022年10月3日 5類感染症 の「麻しん」を更新しました
- 2022年10月3日 5類感染症 の「風しん」を更新しました
- 2022年10月3日 5類感染症 の「先天性風しん症候群」を更新しました
- 2022年10月3日 5類感染症 の「麻しん」、「風しん」の「麻しん・風しん同時検査法」マニュアルを追加しました
- 2022年8月12日 5類感染症 の「RSウイルス感染症」を更新しました
- 2022年8月5日 4類感染症 の「サル痘」を更新しました
- 2022年6月17日 4類感染症 の「サル痘」を追加しました
- 2022年5月18日 5類感染症 の「アデノウイルス下痢症」を更新しました
- 2022年4月26日 3類感染症 の「腸管出血性大腸菌感染症」を更新しました
- 2022年2月9日 4類感染症 の「狂犬病」を更新しました
- 2022年2月3日 新型コロナウイルスゲノム解析マニュアル を更新しました
- 2022年1月31日 4類感染症 の「狂犬病」を更新しました
- 2022年1月4日 5類感染症 の「侵襲性インフルエンザ菌感染症」を追加しました
- 2021年12月6日 4類感染症 の「ブルセラ症」を更新しました
- 2021年11月9日 新型コロナウイルスゲノム解析マニュアル を追加しました
- 2021年9月17日 3類感染症 の「腸チフス」「パラチフス」を更新しました
- 2021年9月8日 3類感染症 の「腸管出血性大腸菌感染症」を更新しました
- 2021年7月16日 5類感染症 の「感染性胃腸炎 –サポウイルス–」を追加しました
- 2021年4月23日 5類感染症 の「侵襲性肺炎球菌感染症」を追加しました
- 2021年2月23日 「感染研・地衛研専用」SARS-CoV-2 遺伝子検出・ウイルス分離マニュアル を更新しました
- 2020年12月25日 5類感染症 の「侵襲性髄膜炎菌感染症」を更新しました
- 2020年12月11日 5類感染症 の「破傷風」を更新しました
- 2020年11月9日 2類感染症 の「ジフテリア」を更新しました
- 2020年9月28日 3類感染症 の「腸チフス」「パラチフス」を更新しました
- 2020年9月10日 5類感染症 の「百日咳」を更新しました
- 2020年9月8日 5類感染症 の「ウイルス性肝炎（E型肝炎及びA型肝炎を除く）」を追加しました
- 2020年9月4日 4類感染症 の「レジオネラ症」を更新しました
- 2020年8月12日 4類感染症 の「重症熱性血小板減少症候群（病原体がフレボウイルス属SFTSウイルスであるものに限る。）」を追加しました
- 2020年6月12日 5類感染症 の「RSウイルス感染症」を追加しました
- 2020年6月4日 5類感染症 の「薬剤耐性菌感染症」（メチシリン耐性黄色ブドウ球菌感染症、ペニシリン耐性肺炎球菌感染症、バンコマイシン耐性腸球菌感染症、薬剤耐性緑膿菌感染症、薬剤耐性アシネトバクター感染症、カルバペネム耐性腸内細菌科細菌感染症）を更新しました
- 2020年4月17日 「新型コロナウイルス感染症」をポータルページに変更し、「検査法の運用について（第3版）」を追加しました
- 2020年3月31日 4類感染症 の「コクシジオイデス症」を更新しました
- 2020年3月24日 5類感染症 の「感染性胃腸炎 –アデノウイルス下痢症–」を追加しました
- 2020年3月19日 指定感染症 の「新型コロナウイルス感染症」を更新しました
- 2020年3月18日 指定感染症 の「新型コロナウイルス感染症」を更新しました
- 2020年3月5日 指定感染症 の「新型コロナウイルス感染症」を更新しました
- 2020年3月5日 指定感染症 の「新型コロナウイルス感染症」を更新しました
- 2020年2月25日 指定感染症 の「新型コロナウイルス感染症」を更新しました
- 2020年2月17日 指定感染症 の「新型コロナウイルス感染症」を更新しました
- 2020年2月15日 指定感染症 の「新型コロナウイルス感染症」を更新しました
- 2020年2月14日 指定感染症 の「新型コロナウイルス感染症」を更新しました
- 2020年2月12日 5類感染症 の「麻しん」「風しん」に付属資料「系統樹作成用の参照株FASTAフォーマット」を追加しました
- 2020年2月6日 指定感染症 の「新型コロナウイルス感染症」を更新しました
- 2020年2月4日 指定感染症 の「新型コロナウイルス感染症」を追加しました
- 2020年1月9日 4類感染症 の「Bウイルス病」を更新しました
- 2019年12月16日 4類感染症 の「炭疽」を更新しました
- 2019年11月22日 5類感染症 の「後天性免疫不全症候群」を更新しました
- 2019年10月15日 5類感染症 の「髄膜炎菌性髄膜炎」を更新しました
- 2019年9月25日 3類感染症 の「腸管出血性大腸菌感染症」を更新しました
- 2019年7月4日 5類感染症 の「風しん」を更新しました
- 2019年6月28日 4類感染症 の「つつが虫病」「日本紅斑熱」「ロッキー山紅斑熱」を追加しました
- 2019年6月19日 5類感染症 の「感染性胃腸炎 –ロタウイルス–」を更新しました
- 2019年6月11日 5類感染症 の「感染性胃腸炎 –ノロウイルス–」を追加しました
- 2019年1月16日 5類感染症 の「インフルエンザ（鳥インフルエンザ及び新型インフルエンザ等感染症を除く）」を更新しました
- 2018年12月7日 5類感染症 の「播種性クリプトコックス症」を追加しました
- 2018年12月7日 4類感染症 の「A型肝炎」を追加しました
- 2018年12月7日 4類感染症 の「E型肝炎」を追加しました
- 2018年10月31日 5類感染症 の「後天性免疫不全症候群」を更新しました
- 2018年10月25日 5類感染症 の「後天性免疫不全症候群」を更新しました
- 2018年2月22日 5類感染症 の「手足口病」「ヘルパンギーナ」「無菌性髄膜炎」を更新しました
- 2017年12月13日 各マニュアルの更新月を追記しました
- 2017年9月11日 5類感染症 の「クリプトスポリジウム症・ジアルジア症」を更新しました
- 2017年8月1日 5類感染症 の「風しん」を更新しました
- 2017年3月31日 5類感染症 の「麻しん」を更新しました
- 2017年3月3日 3類感染症 の「腸管出血性大腸菌感染症」と5類感染症 の「咽頭結膜熱・流行性角結膜炎」を更新しました
- 2017年2月13日 4類感染症 に「ニパウイルス感染症およびヘンドラウイルス感染症」を追加しました
- 2016年12月26日 「耐性菌検出マニュアル」の35頁表3の増幅産物サイズ標記修正に伴い、同マニュアルをバージョンv1.1に改訂しました
- 2016年12月16日 5類感染症 に「カルバペネム耐性腸内細菌科細菌感染症」を追加しました
- 2016年3月10日 4類感染症 に「ジカウイルス感染症」を追加しました
